讃岐うどんチェーンで知られる丸亀製麵は香川県創業ではない、というニュースを見ました。
香川県内では、店舗も閉店が相次ぎ、残り１店舗だそうです。

うどん県である香川県民にとっては、安くて美味しい讃岐うどんが食べられる地元のお店がたくさんあるので、あえて少し高めの価格設定の丸亀製麵には行かない、という分析がもっともらしく聞こえます。

昔の首都圏の駅にある立ち食いそば・うどんのお店は、提供の早さ優先で、あまり美味しい印象はありませんでした。
それに比べたら、丸亀製麵は、麺にこだわり、自家製麺で、西日本のつゆ（東京のつゆは色が黒い）で、美味しく感じますが、本場香川では地元のお店の人気に勝てないようです。

香川創業でもないのに、丸亀を名乗るな、という厳しい意見もあるそうです。

でも、創業の地と店名・社名が食い違っているケースは、ときどきあります。
築地銀だこ（群馬県創業）
フランスベッド（日本のメーカー）

その地名への憧れや宣伝効果を期待して、社名の一部になり、長年、事業を継続して、社名が定着すると、社名自体がブランドとなっているので、今さら変えられない、という感じでしょうか。

調べれば、ほかにももっとあるような気がします。